Hallo morgan und willkommen im Forum
Es kann durchaus ein gesundheitliches Problem sein, darum ist es gut wenn du es, wie Eifelkater schon sagte, vom Tierarzt durchchecken lässt. Bei dieser Gelegenheit solltest du auch gleich das Geschlecht kontrollieren lassen und sofern es ein Männchen ist, überprüfen lassen ob er kastriert ist.
Es muss aber nicht zwingend einen gesundheitlichen Hintergrund haben (trotzdem bitte abklären lassen!)
In einer neuen Umgebung kann es durchaus vorkommen, dass Kaninchen, die vorher stubenrein waren, es zuanfang nicht mehr sind. Es kann eine weile dauern bis es sich einpendelt.

Damit er/sie sich schneller wieder daran gewöhnt auf die Toilette zu gehen solltest du immer an das Eck vom Bett möglichst nah an der Stelle wo das Kaninchen hin macht am Boden eine Katzentoilette mit normalen Einstreu und Heu aufstellen. Wenn du es irgendwie aufsaugen kannst mit Klopapier, tu das und leg das vollgesaugte Klopapier in die Kaninchentoilette. Mit den Köttel gehst du auch so vor, einfach reinlegen. Dann wird das von dir aufgestellt Klo schneller akzeptiert.
Eifelkater hätte es netter formulieren können; aber ja, Kaninchen hält man nicht alleine. Es sind hochsoziale Tiere die zwingend einen Artgenossen brauchen, darum solltest du es vom Tierarzt kontrollieren lassen und bald ein zweites Kaninchen dazu holen.
Die beste und einfachste Kombination ist ein Weibchen und ein kastriertes Männchen.
Das Männchen muss nach der Kastration mindestens 6 Wochen warten bevor es zu einem Mädchen darf (vorher ist er noch zeugungsfähig).
Der Tierschutz quillt über mit tollen Kaninchen (jeden Alters, gesund und die Männchen sind bereits kastriert). Anlaufstellen sind z.B. Tierheim, Kaninchenhilfe (
http://www.kaninchenhilfe.com/), Kaninchenschutz e.V. (
http://www.kaninchenschutz.de/) und diverse kleine private Pflegestellen und andere Organisationen. Du wirst bestimmt fündig.
Bitte NICHT aus dem Zooladen, damit unterstützt du nur schlimmste Tierquälerei, schau hier:
http://gegen-zooladenkaeufe.de/
Bitte lies dich hier gut ein:
http://diebrain.de/ dort findest du alle wichtigen Informationen zur Kaninchenhaltung.
Sie müssen außerdem richtig vergesellschaftet werden. Im genannten Link findest du einen Leitfaden oder auch hier:
https://www.tierforum.de/t106570-die-vergesellschaftung-von-kaninchen-ein-leitfaden.html
Bitte berichte doch wie es bei dir weiter geht
liebe Grüße